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自2021年7月(yue)(yue)30日寧夏(xia)確(que)診(zhen)外省輸入病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)張某某，7月(yue)(yue)31日22時(shi)采集到合格基(ji)因測序(xu)標本(ben)，中(zhong)心領導立即部(bu)署深度測序(xu)工作(zuo)，組織專(zhuan)業技術人員，日夜不(bu)停地開(kai)展(zhan)測序(xu)工作(zuo)，通過(guo)文庫制備(bei)、簇生成(cheng)、上機測序(xu)與數(shu)據比對分(fen)析(xi)，最終在36小(xiao)時(shi)后，于8月(yue)(yue)2日完(wan)成(cheng)該(gai)病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)全(quan)基(ji)因組測序(xu)，確(que)定該(gai)標本(ben)為德爾塔毒株。通過(guo)與國家疾控(kong)中(zhong)心的(de)數(shu)據庫比對，該(gai)病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)基(ji)因組序(xu)列和江蘇省7月(yue)(yue)24日以來報(bao)送本(ben)土病(bing)(bing)(bing)(bing)例(li)新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒基(ji)因組完(wan)全(quan)一致，共(gong)享全(quan)部(bu)突變位點，高度同源(yuan)(yuan)。此次基(ji)因組測序(xu)工作(zuo)的(de)完(wan)成(cheng)，標志(zhi)著寧夏(xia)疾病(bing)(bing)(bing)(bing)預防控(kong)制中(zhong)心已具備(bei)新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)(bing)毒基(ji)因組高通量二(er)代測序(xu)能力，可為寧夏(xia)新(xin)型冠狀病(bing)(bing)(bing)(bing)毒疫(yi)情以及其他傳染(ran)病(bing)(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)(bing)原體的(de)鑒定和溯源(yuan)(yuan)、防控(kong)應對提供(gong)技術支(zhi)撐。
基因(yin)組測序可在(zai)第一(yi)(yi)時間獲取新發(fa)未知病(bing)(bing)毒(du)的基因(yin)組序列信息(xi)，已成為研究(jiu)疾病(bing)(bing)暴發(fa)的重(zhong)要(yao)工(gong)具(ju)。通過構建進(jin)化樹(shu)，研究(jiu)不同患者病(bing)(bing)毒(du)遺傳序列變化，能在(zai)分子生(sheng)物(wu)學(xue)層面揭示病(bing)(bing)毒(du)的傳播方式，分析新冠病(bing)(bing)毒(du)的進(jin)化來源，研究(jiu)新冠病(bing)(bing)毒(du)的致病(bing)(bing)病(bing)(bing)理機(ji)制(zhi)，為控制(zhi)疫情暴發(fa)提供(gong)科學(xue)依據(ju)。通過檢測新冠病(bing)(bing)毒(du)的全(quan)基因(yin)組序列，再將(jiang)這個(ge)序列通過算(suan)法與數據(ju)庫中的數據(ju)進(jin)行比對(dui)，可以初步判(pan)斷其地域來源。將(jiang)序列與既往病(bing)(bing)例(li)序列進(jin)行比對(dui)，如果序列在(zai)同一(yi)(yi)進(jin)化樹(shu)分支上，則可以判(pan)斷這些病(bing)(bing)例(li)是否來自同一(yi)(yi)傳播鏈或傳染源。
此(ci)次疫情病原體為德爾塔(ta)(ta)變異株(zhu)，德爾塔(ta)(ta)變異株(zhu)與(yu)其他(ta)變異株(zhu)相比，在S蛋白上(shang)新增了(le)“L452R”、“T478K”和“P681R”3個(ge)重要突(tu)(tu)變。這些突(tu)(tu)變導(dao)致病毒具(ju)有(you)傳播力(li)強、潛伏期短、病毒載量高、病程進展(zhan)快等特點。在此(ci)提醒(xing)廣大群眾，減少聚集，保持(chi)社(she)交距離，防止疫情擴(kuo)散。
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