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寧夏疾病預防控制中心首次開展新冠病例基因溯源檢測工作

訪(fang)問量: 69來源:本站作者: 時間(jian):2022-08-05分享:

  自2021年7月(yue)(yue)30日(ri)寧(ning)夏確(que)診(zhen)外省輸入(ru)病(bing)(bing)(bing)例(li)張某某,7月(yue)(yue)31日(ri)22時(shi)采集(ji)到合格基(ji)因(yin)測(ce)(ce)序(xu)(xu)標(biao)本,中(zhong)心(xin)領導(dao)立即部(bu)署(shu)深度測(ce)(ce)序(xu)(xu)工作,組(zu)(zu)(zu)織(zhi)專業(ye)技(ji)術人員(yuan),日(ri)夜不停地(di)開展測(ce)(ce)序(xu)(xu)工作,通過文(wen)庫制備、簇生成(cheng)、上機測(ce)(ce)序(xu)(xu)與(yu)(yu)數據比對分(fen)析,最終(zhong)在36小時(shi)后,于8月(yue)(yue)2日(ri)完成(cheng)該(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)全基(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu),確(que)定(ding)該(gai)標(biao)本為德(de)爾塔毒(du)(du)株。通過與(yu)(yu)國(guo)家疾(ji)控中(zhong)心(xin)的(de)數據庫比對,該(gai)病(bing)(bing)(bing)例(li)基(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)序(xu)(xu)列和江(jiang)蘇省7月(yue)(yue)24日(ri)以(yi)來報送本土病(bing)(bing)(bing)例(li)新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)基(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)完全一致(zhi),共享全部(bu)突變位點,高(gao)度同源(yuan)。此(ci)次基(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)工作的(de)完成(cheng),標(biao)志(zhi)著寧(ning)夏疾(ji)病(bing)(bing)(bing)預防(fang)控制中(zhong)心(xin)已具備新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)基(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)高(gao)通量(liang)二代測(ce)(ce)序(xu)(xu)能(neng)力(li),可為寧(ning)夏新(xin)型冠狀病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)疫(yi)情以(yi)及其(qi)他傳(chuan)染病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)原體的(de)鑒定(ding)和溯源(yuan)、防(fang)控應對提(ti)供技(ji)術支撐(cheng)。
  基(ji)因組測序(xu)(xu)(xu)(xu)可(ke)(ke)在(zai)第一(yi)時間(jian)獲取新(xin)發(fa)未知病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)的(de)(de)(de)基(ji)因組序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)信息,已(yi)成為研(yan)究疾病(bing)(bing)(bing)暴(bao)發(fa)的(de)(de)(de)重要工具。通過(guo)構建進化(hua)(hua)樹(shu),研(yan)究不同(tong)患者(zhe)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)遺(yi)傳(chuan)(chuan)(chuan)序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)變化(hua)(hua),能在(zai)分子生物學層(ceng)面揭示(shi)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)的(de)(de)(de)傳(chuan)(chuan)(chuan)播方式,分析新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)的(de)(de)(de)進化(hua)(hua)來源(yuan),研(yan)究新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)的(de)(de)(de)致病(bing)(bing)(bing)病(bing)(bing)(bing)理機制,為控制疫(yi)情暴(bao)發(fa)提供科學依據。通過(guo)檢測新(xin)冠病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)的(de)(de)(de)全基(ji)因組序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie),再將這個序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)通過(guo)算法與數據庫中的(de)(de)(de)數據進行比(bi)對(dui),可(ke)(ke)以初步判斷其地域來源(yuan)。將序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)與既往病(bing)(bing)(bing)例序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)進行比(bi)對(dui),如果(guo)序(xu)(xu)(xu)(xu)列(lie)在(zai)同(tong)一(yi)進化(hua)(hua)樹(shu)分支上,則可(ke)(ke)以判斷這些病(bing)(bing)(bing)例是否來自同(tong)一(yi)傳(chuan)(chuan)(chuan)播鏈或(huo)傳(chuan)(chuan)(chuan)染源(yuan)。
  此次(ci)疫情(qing)(qing)病(bing)原(yuan)體為(wei)德爾(er)塔(ta)變(bian)異株,德爾(er)塔(ta)變(bian)異株與其(qi)他變(bian)異株相比,在S蛋白上新增(zeng)了“L452R”、“T478K”和“P681R”3個重要突變(bian)。這些突變(bian)導致病(bing)毒具有傳播力強、潛(qian)伏期(qi)短、病(bing)毒載(zai)量高、病(bing)程進展快等(deng)特點。在此提醒廣大群眾(zhong),減(jian)少(shao)聚(ju)集,保持社(she)交距離,防止疫情(qing)(qing)擴(kuo)散。

 

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